影片改编自周浩晖豆瓣高分悬疑小说。以“审判者”自居的神秘杀手Darker公开挑衅警方，接连发出“死亡通知单”，收到之人都会被残忍处决。为查清真相，爆炸案目击者黄少平（古天乐饰）、天才警察罗飞（张智霖饰）、专案组组长韩灏（吴镇宇饰）纷纷入局。Darker究竟是谁？真相不断反转，惊人的秘密逐渐浮出水面……

在三联帮有杰出表现的山鸡（陈小春饰）即将迎娶日本帮派山田组的头目草刈一雄（千叶真一饰）的女儿菜菜子（安雅饰）。身为好友的陈浩南（郑伊健饰）及一众香港的黑帮头目也到日本出席了山鸡的婚礼。三联帮帮主的儿子雷复轰是个有能之士，对父亲的帮派事业毫无兴趣。山鸡成了他心中继承位置的最佳人选，却遭到了同是帮内头目的忠勇伯的反对，他决意要与山鸡争取帮主的地位。两人明争暗斗，忠勇伯这时被袭击了，他认定山鸡指使了人攻击他。俩人再次因为有关政府的方案而互相对立，帮派内讧。山鸡除了事业上的不如意，妻子菜菜子更被父亲手下强奸了。山鸡正处在水深火热之中，陈浩南前往台湾助山鸡一臂之力，雷复轰却为了帮内团结要把让忠勇伯当帮主。忠勇伯竟在这个时候被杀了，山鸡再次被嫌疑……

进队不久的缉毒警成杰在抓捕毒贩时被咬疑似感染艾滋病，队长刘云飞接到通知江城会有一场大的毒品交易。在抓捕毒贩破除成杰感染艾滋病同时，嫌疑人于长蒲进入警方视线。经查于长蒲只是被利用，而幕后毒枭是矿主杨江。

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明石幸次（阿部进之介饰）的父亲因告发企业内部的非法行为而被逼自杀，幸次的家庭也因此分崩离析。这时，在儿童福利院工作的北村向幸次伸出援手，在他看来，只要能守护孩子们就算犯罪也在所不惜。在北村另类价值观的影响下，幸次心里燃起了报仇的火焰，人性的善与恶再次交锋……

毒枭康素差（刘青云饰）一直带着手下张建行（郭富城饰）从事毒品交易，新加入的成员欧志远（古天乐饰）也因一次意外与两人有了过命交情，三人情同手足。康素差在香港的贩毒生意被警方查处后带团队逃到金三角发展，却意外发现身边藏有卧底。此刻，是敌是友，一片茫然。