1929年，天津，警察厅厅长儿子廖盛辉被一神秘人牵扯进一个精心布好的迷局，指引他一步步去探寻14年前圣南孤儿院大火所掩藏的秘密，一批来历不明的敦煌文物，一件震惊全市的连环毒杀案，共产党、国民党、日本人、北洋军阀等多方势力都介入这场迷局展开角斗。 廖盛辉的解谜之路困难重重，他面对的是强有力的对手——心思缜密的国民党特工曾家扬、身手不凡的日本忍者郁子。随着谜题逐步解开，日本人和国民党的罪恶目的暴露无遗，可真相却让廖盛辉难以承受：他和曾家扬、郁子都是当年孤儿院的伙伴。最终分属不同阵营的三人携手共同抗敌，却无奈遭到失败。1937年抗战全面爆发，已经成长为坚定的共产主义战士的三人再度重逢，他们携手走上了抗日救亡的新战场。

韩国富商公子金正浩（金桢勋 饰）幼年曾在上海生活十年，他的心中藏有一个未曾表白的初恋情结，那个女孩叫欧阳明明（陈紫涵 饰），他借这次担任上海分部经理的机会，要找到明明敞开心扉。当今的明明己是一颗耀眼的未来之星，经纪人王文清（袁文康 饰）对金正浩的突然出现表示出明显敌意，而正浩也察觉了两人的恋人关系。如何在竟争中取胜，正浩求教老师亚苏（吴孟达 饰），亚苏告诉他要用《孙子兵法》中的计谋战胜对手，而王文清则用同样的手段应对正浩。经过一番折腾，正浩发现明明已不是从前那个心中的女神，变的飞扬跋扈，而自己的心却慢慢与自己的服装师孙雨萱（徐若瑄 饰）贴近......

在官场摸爬滚打多年的马向阳（吴秀波 饰），虽然只是商务局市场科的一个小科长，却早已熟稔官场避实就虚、虚与委蛇的生存法则和太极推手。谁知突如其来的一纸调令，却将他从优哉游哉的城市达到了作为重点扶贫对象的穷乡僻壤。他从一位科长摇身一变成为大槐树村第一书记，但是这顶乌纱帽可真不那么好戴，从没有过乡村工作经验的他束手无策，不明所以，而当面对学识渊博且实践经验丰富的种植专家周冰（王雅捷 饰）、凭借血缘宗族关系在当地享有极高声望的族长刘世荣（李洪涛 饰） 性格泼辣的留守妇女代表李云芳（梁爱琪 饰）等不同身份之人的时候，许多问题似乎变得更不好解决。　　肩负着领导殷勤期望的马书记，能否升任这一新的岗位呢？

西南某灾区迎来了救援医疗队和志愿者们，随队而来的还有女演员秦翡。人人都说秦翡来当志愿者不过是为了作秀，然而，秦翡却认真努力，还在危急时刻舍身救人。日夜相处中，医疗队队长行知止看到了秦翡内心的坚韧和善良，两人加深了彼此了解。秦翡也发现多年前自己参加舞蹈比赛时遭遇意外，在危急时刻救了自己的命、也令自己重燃希望的年轻医生正是行知止。他们的缘分在很早之前就已经结下。两人在生活中相互扶持，在事业上各自努力，行知止再次参与重要救援任务，秦翡凭借努力重新获得大众认可。秦翡对行知止说，你以生命救援生命，你答应过我，平安归来，你说的话我都相信，哪怕谎言也动听。

本剧将延续《家有爹娘》第一部的整体风格，继续讲述王家三世同堂的情感故事。该剧以贴近百姓生活、反映当下社会现状，展示普通人婚姻状况和家庭情感的现实生活为出发点，通过表现价值观念与生活背景迥异的两代人对生活各自不同的态度，显示出极强的现实意义。 王家二媳妇田一的怀孕重新点燃了王起孟（张炬饰）抱孙子的希望，全家人为小生命的到来积极做着准备，然而两代人对怀孕的不同想法也造成了不少误会。随着一个漂亮孙女的诞生，王起孟却郁闷得病倒了……侯淑云（严敏求饰）和王起孟商量，想让前大儿媳刘颖、孙女兰兰、外孙女小桃早日结婚，为他们生个男孩续接香火。 英俊洒脱、才华出众的服装设计师王学兵（张智尧饰）欣赏公司女老板刘颖（朱琳饰）的气质和美丽，穷追刘颖。刘颖犹豫再三，终于鼓起勇气接受这份难得的爱情。当他们就要宣布结婚时，刘颖却发现自己的女儿兰兰一直暗恋王学兵。母女俩爱上同一个男人，令她们陷入感情的痛苦煎熬中，也让王家上下闹翻了天。经过一段时间痛苦的折磨，兰兰和刘颖都把对方的幸福看成是自己最大的幸福，刘颖拒绝了王学兵的爱情，兰兰则决定同男友秦海订婚。在兰兰和秦海的订婚仪式上，王起孟兴奋地催兰兰快要孩子，可是秦海却回答他不想要孩子……

抗日战争时期 ﹐日本制定了一系列恶毒的计划﹐妄图陷害抗日的中国将领﹐企图发动太平洋战争﹐并暗地寻找中国的铀矿资源﹐为制造原子弹作准备。打入敌人内部的袁飞﹐被组织怀疑为叛徒﹐他利用聪明才智证明自己的清白﹐他和在他被解救之下加入中国共产党的侠女欧阳雯﹐国民党军统上海站领袖申剑﹐以及来自苏联和世界的反法西斯联盟特工并肩战斗﹐破坏了日军的“920计划”﹑“海计划”﹐并最终取得了日军制造原子弹的426秘密档案。欧阳雯在执行任务的过程中发现了自己的身世﹐她与自己的生母﹑化名梅若兰的日本特务刀枪相对﹐在国恨家仇与骨肉亲情的抉择中﹐她毅然选择了民族大义﹐却遭到梅若兰的枪杀﹐壮烈牺牲。袁飞最后也将隐藏在共产党高层潘和平身边的日本特务华广奇就地正法。